Gangguan saluran pencernaan adalah masalah yang terjadi pada salah satu organ suatu sistem pencernaan, atau lebih dari satu organ pencernaan secara bersamaan. Sistem pencernaan dimulai dari mulut, kerongkongan, lambung, usus halus, usus besar, dan anus. Organ hati, pankreas, dan kantung empedu juga sangat berperan dalam proses pencernaan makanan, namun tidak dilewati karena terletak di luar saluran pencernaan. Sistem pencernaan berfungsi untuk mencerna makanan agar menjadi nutrisi yang dapat memberikan manfaat bagi tubuh. Nutrisi akan disalurkan ke seluruh tubuh melalui aliran darah. Sistem pencernaan juga berfungsi untuk memisahkan dan membuang bagian makanan yang tidak bisa dicerna oleh tubuh. Ketika tubuh tidak dapat mencerna makanan dengan baik maka dapat menyebababkan intoleransi pencernaan.